Une fois connecté au serveur FTP de votre site, vous pouvez voir plusieurs répertoires.
Vous devez envoyer vos fichiers web (images, pages HTML, pages PHP etc...) dans le répertoire httpdocs.
Les scripts Perl et CGI doivent être placés dans le répertoire cgi-bin.
Les autres répertoires servent aux logs Apache, aux statistiques web et à gérer de manière autonome votre hébergement. Vous n'en avez donc aucune utilité directe.